合同违约三年后超过诉讼时效。依照我国现行《民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期限为3年，法律另有规定的除外。
提醒您，根据《民法典》第一百八十八条的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。
但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长
合同约定违约金不能超过实际违约损失的30%。
当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。
约定的违约金低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加;约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。
当事人就迟延履行约定违约金的，违约方支付违约金后，还应当履行债务。
合同超过诉讼时效的补救方法是：
1.自愿履行
对时效已过之债权，债务人自愿做出给付的，不受法律的禁止，即使是债务人不知时效已过，也不例外。它是债务人抛弃时效利益的结果。
2.承认债务（权）
如果债务人明确承诺将履行“已过时效”之债务，无论何种方式，均构成对原债务（权）的承认。但在实践中，承认的方式常为：双方达成还款协议、债务人在催收单上签章和为原债务提供担保。
3.抵销
在抵销中，为抵销的债权，即债务人的债权，称为主（自）动债权，被抵销的债权，即债权人的债权，称为受动债权。
